自闭症现在最先进的治疗方法，一个是调节他脑神经，神经兴奋和抑制不平衡，脑神经功能紊乱。通过修复大脑皮质层传导信号，修复脑神经递质传导再配合着强化训练，再药物治疗。
像孤独症的孩子伴有多动症的，就可以先以治疗多动症，或者是提高智力。像营养脑的这种药物可以用点，再一个伴有精神疾病的，也可以用点抗精神疾病的药物，再一个像癫痫的这种孩子也可以对症治疗。
孤独症的孩子一般的伴有部分高功能性，就是某一方面超常，但是大部分认知理解不如正常，和正常同龄儿童是不一样的。再有大部分的孤独症的孩子，一般的是伴有智力低下，多动，有的甚至像脾气大，有自残自伤，损坏东西，不听指令摔砸东西。像这种孩子可以到时候配合点精神这一类的药物一块治疗。在家里有的不配合的患儿，在家训练是无法进行的。
有的孩子脾气大不听指令，这种孤独症的孩子大部分都伴有临床症状，不听家长的指令，一般的是到正规的医院通过一对一的科学的训练，才能达到训练目的。不要盲目的去找一些，觉着是捷径，然后把孩子最佳治疗年龄给耽误了。